噬菌体免疫沉淀测序(Phage immunoprecipitation sequencing,PhIP-seq)作为一种新兴的高通量筛选技术,凭借其与高容量噬菌体展示多肽库、抗体免疫沉淀及高通量测序的结合,能够基于抗原-抗体匹配进行全局性和系统性的抗体库(Antibody repertoire)分析。该技术拥有极高的灵敏度,能够进行高通量的抗体与多肽结合检测。通过研究结合位点,深入解析抗体与目标之间的相互作用机制,使得其在自身抗体组研究、感染性疾病相关抗体以及疫苗研发等领域有着重要的应用价值,为解决复杂的免疫学问题提供了有力的工具。
最近,来自荷兰格罗宁根大学的研究团队在国际知名免疫学期刊Immunity上连续发表了两篇关于噬菌体免疫沉淀检测(PhIP-seq)技术的文章,深入分析了人血清的抗体库组成,并首次发现了与炎症性肠病(IBD)相关的特征抗体标志物。这两篇研究利用了相同的噬菌体展示肽库,对超过1000例血清样本进行了细致的筛选与分析。该噬菌体展示肽库包含344,000条多肽,所有多肽均来自于微生物(如肠道微生物、益生菌和致病菌)、致病因子数据库(VFDB)及免疫表位数据库(IEDB),每条肽的单个长度为64个氨基酸,其中相邻肽段的重叠部分为20个氨基酸。
第一篇文章专注于炎症性肠病(IBD),包括克罗恩病(CD)和溃疡性结肠炎(UC)患者的抗体组分析。通过高通量的PhIP-seq技术,研究人员对497例IBD患者及1326例健康对照者的血清抗体进行了对比分析,发现炎症性肠病患者的抗体表位谱与健康对照有显著差异,共获得373种IBD相关的差异表达抗体反应(其中包括202种过度表达和171种低表达的抗体)。接下来,研究者进一步评估了这些多肽与患者临床特征的相关性,发现与疾病活动度、炎症指标及并发症存在一定关系,表明这些抗体可能源于遗传易感性,在发病后被激活或重新定向。
文章作者还选取了部分差异化的肽段,通过递归特征消除(RFE)建立并优化了IBD对照样本的区分模型。研究结果表明,抗体表位谱能够准确区分克罗恩病患者和健康对照者(曲线下面积[AUC]=0.89),仅使用10个抗体也能实现较高的分类准确率(AUC=0.87),这表明这些特异性多肽具有潜在的IBD诊断应用价值。
此外,这项研究对于推动生物医学的进一步发展具有重要意义,帮助更好地理解炎症性肠病的机制与临床表现,为相关的疾病检测与治疗开辟了新的方向。未来,Z6·尊龙凯时将不断关注这一领域的最新研究进展,期待为临床应用提供更多的创新解决方案。